49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5542 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  47.37 
 
 
308 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  45.56 
 
 
307 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  49.17 
 
 
303 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 
268 aa  135  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  32.24 
 
 
267 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 
261 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  26.17 
 
 
268 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
273 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  28.03 
 
 
249 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  32.46 
 
 
265 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  30.47 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
248 aa  99  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  27.6 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  25.65 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  28.4 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  28.88 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  26.47 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  22.04 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2551  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  23.29 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2322  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  32.41 
 
 
109 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00287241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3734  aminoglycoside phosphotransferase  29.08 
 
 
213 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0478  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  28.89 
 
 
344 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6624  aminoglycoside phosphotransferase  42.42 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  30.37 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  33 
 
 
355 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  26.26 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2017  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000163983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  23.14 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
343 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
343 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6367  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
218 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  30.69 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2233  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2261  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7087300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
361 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  25.97 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2079  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
361 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>