40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1212 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
268 aa  550  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  41.73 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  36.5 
 
 
267 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 
286 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  33.88 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 
307 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  28.25 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  27.94 
 
 
265 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 
268 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  26.23 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  27.55 
 
 
250 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  27.38 
 
 
235 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  27.17 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.3 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  29.17 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  27.1 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  22.5 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  23.69 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0478  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  22.83 
 
 
346 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  22.28 
 
 
346 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  24.02 
 
 
337 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  23.6 
 
 
364 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1926  aminoglycoside phosphotransferase  28.3 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00274282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0682  aminoglycoside phosphotransferase  32.5 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.57 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2636  hypothetical protein  35.53 
 
 
93 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0172491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2322  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  31.58 
 
 
109 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00287241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  18.6 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  21.89 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  21.36 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2551  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  35.44 
 
 
192 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 
343 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.04 
 
 
380 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>