42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1247 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
267 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  26.56 
 
 
307 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  26.17 
 
 
286 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 
308 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  25.68 
 
 
303 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  26.77 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  25.36 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  26.89 
 
 
261 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.91 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  28.64 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  26.02 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  25.49 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  26.59 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  24.3 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  24.17 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  25.21 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3734  aminoglycoside phosphotransferase  22.17 
 
 
213 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  21.2 
 
 
344 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
344 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  22.37 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  22.37 
 
 
366 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  22.37 
 
 
366 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  24.6 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  30.59 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  21.39 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
343 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
361 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  25.48 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.26 
 
 
353 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
343 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
361 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  25 
 
 
223 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2229  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
356 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>