195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2229 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2229  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
356 aa  704    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
347 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  32.15 
 
 
339 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  27.83 
 
 
362 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
338 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  30.25 
 
 
350 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  29.8 
 
 
360 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
347 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  32.41 
 
 
341 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
358 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  32.75 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  29.26 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  30.21 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
343 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  29.18 
 
 
354 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  28.62 
 
 
350 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
353 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  28.01 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  28.46 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  27.59 
 
 
363 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.13 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
368 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 
344 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 
354 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  30.15 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  26.71 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  25.38 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.94 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  25.98 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  24.44 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25.98 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  26.91 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  28.86 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  28.85 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 
349 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  25.66 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  27.45 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  28.49 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.26 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  24.59 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  25.68 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  31.92 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  26.81 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  26.72 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  26.72 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.8 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>