36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0054 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  100 
 
 		 153 aa  314  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  84.31 
 
 		 153 aa  276  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  78.29 
 
 		 153 aa  254  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  79.08 
 
 		 152 aa  254  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  72 
 
 		 154 aa  233  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  66 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  69.8 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  66.23 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  65.58 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  68.67 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  65.58 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  64.29 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  62.34 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  52.7 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  52 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  45.03 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  42.38 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  38.93 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18521  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  27.01 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18331  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  27.01 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243419  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1735  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  27.01 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1314  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  36.99 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1531  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  36.76 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07120  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  30.15 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3257  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.71 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0550379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0023  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.44 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3164  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.71 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1073  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.67 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.714061  hitchhiker  0.000318668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3116  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  39.71 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.784268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0830  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  36.76 
 
 		 157 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00102781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3455  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  34.72 
 
 		 155 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0845  riboflavin synthase  36.36 
 
 		 158 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1019  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.53 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0366268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2898  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.24 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3089  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.24 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>