19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1495 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  99.36 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  97.44 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  89.74 
 
 		 156 aa  297  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  85.9 
 
 		 156 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  69.13 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  64.71 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  65.58 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  63.64 
 
 		 153 aa  207  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  65.56 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  63.64 
 
 		 152 aa  200  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  64.43 
 
 		 159 aa  199  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  62.25 
 
 		 154 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  49.02 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  43.24 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  41.45 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  39.6 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  38.26 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>