20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0746 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  72.15 
 
 		 159 aa  230  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  75.16 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  72.73 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  71.14 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  69.13 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  69.13 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  68.46 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  68.67 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  68.67 
 
 		 153 aa  208  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  67.33 
 
 		 153 aa  207  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  66.67 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  64 
 
 		 152 aa  186  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  50 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  45.45 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  46.75 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  47.4 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  45.45 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  44.16 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1435  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  30 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>