23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0057 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  78.29 
 
 		 153 aa  254  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  76.97 
 
 		 153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  73.68 
 
 		 152 aa  238  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  69.33 
 
 		 154 aa  223  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  69.8 
 
 		 159 aa  217  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  65.33 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  64.71 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  64.71 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  63.4 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  67.33 
 
 		 161 aa  207  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  62.09 
 
 		 156 aa  203  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  63.16 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  50 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  50 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  46.1 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  43.62 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  42.38 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  42.28 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0168  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  32.26 
 
 		 136 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0071341  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18521  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.71 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1735  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.71 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18331  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.71 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>