20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0047 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  100 
 
 		 156 aa  318  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  79.74 
 
 		 155 aa  253  5e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  58.67 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  59.33 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  57.33 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  58.67 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  50.33 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  52.7 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  47.97 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  50 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  49.32 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  47.33 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  44.44 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  45.45 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  44.59 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  43.24 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  43.24 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  43.24 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  43.24 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04397  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>