19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1285 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  100 
 
 
152 aa  307  4e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  85.53 
 
 
152 aa  279  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  86.84 
 
 
152 aa  277  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  82.24 
 
 
152 aa  263  7e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  61.33 
 
 
155 aa  173  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  59.33 
 
 
156 aa  167  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  44.74 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  46.05 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  45.45 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  45.51 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  42.57 
 
 
152 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  45.03 
 
 
153 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  46.1 
 
 
153 aa  103  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  42.28 
 
 
156 aa  103  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  41.06 
 
 
156 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  40.4 
 
 
156 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  45.03 
 
 
153 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  41.45 
 
 
156 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  38.16 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>