68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0419 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  84.31 
 
 		 153 aa  276  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  77.12 
 
 		 152 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  76.97 
 
 		 153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  67.33 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  69.13 
 
 		 159 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  63.64 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  63.64 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  61.33 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  63.64 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  62.34 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  66.67 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  59.74 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  49.32 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  44.67 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  45.03 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  40.94 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  41.72 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2236  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.4 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0388  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.11 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1314  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.36 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1531  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  30.43 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2781  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  26.57 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0023  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.44 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3116  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.65 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.784268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0561  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  32.39 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.65265  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1735  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  27.74 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2898  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.36 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3257  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.65 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0550379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3164  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  42.65 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18331  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  27.74 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243419  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18521  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  27.74 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3089  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  36.99 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0845  riboflavin synthase  29.51 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1019  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.16 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0366268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3455  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  34.72 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0446  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00367  hypothetical protein  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.804635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0497  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0336  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.698717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0451  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3218  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07120  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.87 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.262765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3194  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0830  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.24 
 
 		 157 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00102781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0897  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.93 
 
 		 156 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.498749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0486  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0883  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00363  riboflavin synthase subunit beta  41.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1038  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  29.27 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3705  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.71 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1073  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  38.67 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.714061  hitchhiker  0.000318668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1214  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912271  normal  0.250843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3157  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000573174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2775  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000302162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2285  riboflavin synthase  29.6 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3155  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000230822  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0423  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  33.33 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3300  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000566422  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1691  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.33 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1276  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.62 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000153219  unclonable  0.0000000000568177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1165  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1621  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  37.84 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3466  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1099  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000368267  normal  0.587736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1099  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.46 
 
 		 180 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581145  normal  0.593751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1681  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  30.17 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>