37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0515 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  100 
 
 
154 aa  315  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  81.05 
 
 
154 aa  268  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  72.73 
 
 
161 aa  226  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  69.28 
 
 
159 aa  221  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  66 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  65.33 
 
 
153 aa  214  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  61.33 
 
 
153 aa  207  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  64.24 
 
 
152 aa  206  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  62.91 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  62.25 
 
 
156 aa  194  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  62.25 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  62.25 
 
 
156 aa  192  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  63.33 
 
 
156 aa  191  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  44.44 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  45.03 
 
 
155 aa  123  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  44.74 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  45.39 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  44.08 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  44.08 
 
 
152 aa  114  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0168  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  34.34 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0071341  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18521  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.99 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1735  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.99 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18331  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  28.99 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3017  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2017  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3070  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2596  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0763  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1530  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3103  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2146  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.34 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2477  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  32.14 
 
 
140 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18331  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  26.81 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.345404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0388  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  35.35 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1720  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  37.25 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.586437  normal  0.0171526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1435  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  26.26 
 
 
193 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2076  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  31.48 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.158967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>