19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1379 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  79.74 
 
 
156 aa  253  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  62.67 
 
 
152 aa  177  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  61.33 
 
 
152 aa  173  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  60 
 
 
152 aa  171  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  58.67 
 
 
152 aa  168  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  50.65 
 
 
159 aa  147  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  50.33 
 
 
156 aa  140  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  50 
 
 
161 aa  140  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  49.02 
 
 
156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  49.02 
 
 
156 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  49.02 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  49.02 
 
 
156 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  52 
 
 
153 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  47.33 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  50 
 
 
153 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  44.67 
 
 
153 aa  123  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  45.03 
 
 
154 aa  123  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  46.67 
 
 
154 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>