19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1013 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  87.5 
 
 		 152 aa  279  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  82.24 
 
 		 152 aa  263  7e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  80.92 
 
 		 152 aa  261  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  58.67 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  57.33 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  44.08 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  47.4 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  42.76 
 
 		 154 aa  105  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  40.54 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  42.28 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  40.94 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  42.11 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  43.62 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  40.27 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  40.94 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>