19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0923 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0923  riboflavin synthase  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.561706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1180  riboflavin synthase  86.54 
 
 
156 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0891579  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0771  riboflavin synthase  85.9 
 
 
156 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1495  riboflavin synthase  85.9 
 
 
156 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1184  riboflavin synthase  82.69 
 
 
156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.185157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0746  riboflavin synthase  68.67 
 
 
161 aa  211  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0057  riboflavin synthase  63.16 
 
 
153 aa  201  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0054  riboflavin synthase  62.34 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0419  riboflavin synthase  59.74 
 
 
153 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0515  riboflavin synthase  63.33 
 
 
154 aa  191  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2081  riboflavin synthase  64 
 
 
154 aa  190  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000484494  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0842  riboflavin synthase  61.33 
 
 
159 aa  189  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2476  riboflavin synthase  61.18 
 
 
152 aa  185  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1379  riboflavin synthase  49.02 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0664161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0047  riboflavin synthase  44.59 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.01198  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1013  riboflavin synthase  40.27 
 
 
152 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.495094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1833  riboflavin synthase  39.47 
 
 
152 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000113507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2083  riboflavin synthase  38.26 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.149054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1285  riboflavin synthase  38.16 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>