More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0671 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0671  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  85.27 
 
 		 130 aa  225  2e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68.03 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  61.9 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 134 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 134 aa  167  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  67.19 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  167  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 130 aa  166  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  55.56 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  55.56 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  55.47 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  56.56 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  67.97 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  55.47 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  54.92 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  64.84 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  56.56 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  62.61 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  62.61 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  53.97 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  61.74 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  63.28 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  54.92 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  54.92 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  54.92 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>