More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf247 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf247  ribosomal protein L19  100 
 
 
118 aa  233  6e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0015977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  65.52 
 
 
116 aa  153  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  62.93 
 
 
119 aa  141  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  59.65 
 
 
116 aa  139  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60.55 
 
 
118 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
116 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 
116 aa  135  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 
116 aa  135  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 
113 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
114 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  57.8 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 
116 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
162 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  60.18 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 
119 aa  127  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  54.63 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  53.98 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  52.21 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 
115 aa  125  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
115 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  51.82 
 
 
115 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
120 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
133 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 
116 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 
118 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  52.73 
 
 
118 aa  123  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  54.39 
 
 
118 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  54.63 
 
 
119 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
113 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  52.73 
 
 
113 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  52.78 
 
 
113 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 
118 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
115 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
113 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  52.29 
 
 
113 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
113 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
113 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
127 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
113 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  51.35 
 
 
117 aa  120  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  56.6 
 
 
117 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
119 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
128 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
115 aa  120  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  50.45 
 
 
113 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  55.05 
 
 
114 aa  120  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
117 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  51.3 
 
 
148 aa  120  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
117 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  52.29 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2876  50S ribosomal protein L19  62.63 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  52.78 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  51.38 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  56.88 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  60.42 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  49.07 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  51.38 
 
 
118 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1945  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
134 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
137 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  51.85 
 
 
118 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 
117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 
158 aa  117  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0339925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>