167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00735 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  100 
 
 		 154 aa  313  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  86.36 
 
 		 154 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  79.59 
 
 		 157 aa  244  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  65.33 
 
 		 156 aa  216  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  66 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  67.12 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  66.23 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  66 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  66 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  66.44 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  67.11 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  64.67 
 
 		 160 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  66.22 
 
 		 158 aa  209  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  65.56 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  66 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  65.56 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  65.54 
 
 		 177 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  66.22 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  65.75 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  64.67 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  65.77 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  65.77 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  65.77 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  64.67 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  63.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  63.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  60.13 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  61.81 
 
 		 150 aa  188  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  51.02 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  46.98 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  49.64 
 
 		 195 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  38.78 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  30.46 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  30.46 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  30.46 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  30.46 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  30.46 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  41.43 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  41.43 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  32.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  30.71 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  31.87 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  34.48 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  34.46 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  33.13 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  34.44 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  33.78 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  31.76 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  32.89 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  29.86 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  32.28 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  36.17 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  36.69 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  32.87 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  32.33 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  33.85 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  36.57 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  32.39 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  34.88 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  34.59 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  30.3 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  35.71 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  37.21 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  35.37 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  30.32 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  30.32 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  34.23 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  33.09 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  32.35 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  34.33 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  34.72 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  37.19 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  37.19 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  34.72 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  34.72 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  30.28 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>