178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2836 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  100 
 
 		 172 aa  330  9e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  79.35 
 
 		 159 aa  236  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  78.06 
 
 		 161 aa  236  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  78.71 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  78.71 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  76.13 
 
 		 161 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  75 
 
 		 176 aa  230  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  71.43 
 
 		 161 aa  222  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  70.59 
 
 		 164 aa  211  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  67.32 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  64.94 
 
 		 162 aa  174  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  58.71 
 
 		 178 aa  170  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  57.05 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  55.56 
 
 		 187 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  54.49 
 
 		 185 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  57.23 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  55.13 
 
 		 186 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  53.21 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  54.14 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  53.16 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  53.99 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  55.13 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  61.04 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  55.19 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  54.37 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  53.61 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  52.94 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  59.74 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  54.72 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  57.66 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  50.64 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  47.13 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  59.02 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  47.33 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  46.84 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  43.04 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  37.66 
 
 		 150 aa  104  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  36.99 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  35.29 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  35.29 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  41.48 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  34.64 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  37.25 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  35.06 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  37.25 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  35.37 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  46.46 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  32.67 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  33.12 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  34.42 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  33.99 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  38 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  37.93 
 
 		 142 aa  94  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  30.72 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  32.91 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  32.91 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  36.13 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  38.41 
 
 		 148 aa  87.8  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  40.41 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  33.81 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 148 aa  85.5  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  39.26 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  36.73 
 
 		 152 aa  84  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  34.48 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  36.3 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  31.01 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  31.54 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  34.87 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  31.54 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  36.96 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  38.67 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  43.31 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  34.46 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  43.31 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  37.16 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  29.79 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  29.41 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  34.78 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  37.24 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  35.71 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  37.76 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  37.5 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  37.5 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>