175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1116 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  63.25 
 
 		 175 aa  207  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  60 
 
 		 172 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  54.59 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  59.38 
 
 		 168 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  57.41 
 
 		 176 aa  174  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  52.72 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  55 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  53.16 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  55.06 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  51.12 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  51.41 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  50.3 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  50.91 
 
 		 177 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  48.07 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  52.26 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  50.98 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  49.4 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  50.31 
 
 		 167 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  51.9 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  51.66 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  51.95 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  50.99 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  50.33 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  50.33 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  50.33 
 
 		 159 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  50 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  47.02 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  48.33 
 
 		 172 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  49.41 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  49.69 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  48.47 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  43.95 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  41.36 
 
 		 170 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  46.59 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  37.25 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  35.46 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  33.54 
 
 		 150 aa  94.7  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  36.97 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  40.43 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  36.94 
 
 		 152 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  32.91 
 
 		 150 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  32.91 
 
 		 150 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  34.64 
 
 		 150 aa  88.6  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  88.2  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 153 aa  87.8  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  36.71 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  35.95 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  32.26 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  32.26 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  33.55 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  39.01 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  34.64 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  34.72 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  37.58 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  34.75 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  34.04 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  34.72 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  30.07 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  32.67 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  29.87 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  29.87 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  38.73 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  31.76 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  33.8 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  32.93 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  31.11 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  32.32 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  34.78 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  32.9 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  30.41 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  31.17 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  32.82 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  36.88 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  28.76 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  28.76 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  27.45 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  36.36 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  27.45 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  29.08 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  34.75 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  31.69 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  31.54 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>