177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0673 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  56.8 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  44.31 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  42.5 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  44.59 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  40.61 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  43.48 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  42.21 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  42.57 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  37.89 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  37.89 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  42.36 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  39.87 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  39.24 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  40.51 
 
 		 168 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  44.68 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  38.41 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  40.49 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  39.86 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  41.84 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  42.86 
 
 		 161 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  40.99 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  37.72 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  36.2 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  45.97 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  42.94 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  42.55 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  36.97 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  40.51 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  41.43 
 
 		 159 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  41.43 
 
 		 159 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  41.43 
 
 		 159 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  41.43 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  41.43 
 
 		 171 aa  92  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  43.26 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  87.8  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  38.97 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  30.72 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  34.93 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  33.55 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  34.21 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  32.03 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  38.51 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  37.21 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  35.43 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  31.17 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  35.92 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  34.31 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  32.17 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  32.17 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  29.86 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  29.86 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  32.87 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  37.32 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  37.76 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  32.19 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  32.19 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  34.01 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  29.86 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  32.85 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  33.58 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  31.72 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  29.22 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  34.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  33.1 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  31.65 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  31.58 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  30.66 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  38.57 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  35.38 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  37.41 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  35.61 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  36.22 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  32.68 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  35.07 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  35.46 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  34.04 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  34.04 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  33.83 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  32.37 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  34.75 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  32.37 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  32.37 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  30.82 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  32.03 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  35.56 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>