165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0671 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  100 
 
 		 154 aa  316  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  93.42 
 
 		 156 aa  299  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  94.08 
 
 		 156 aa  297  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  94.08 
 
 		 156 aa  297  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  94.08 
 
 		 156 aa  297  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  93.42 
 
 		 156 aa  297  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  93.42 
 
 		 156 aa  296  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  92.76 
 
 		 156 aa  294  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  92.76 
 
 		 156 aa  294  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  92.76 
 
 		 156 aa  294  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  92.76 
 
 		 156 aa  294  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  92.76 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  91.45 
 
 		 156 aa  293  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  92.11 
 
 		 160 aa  291  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  88.46 
 
 		 156 aa  280  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  90.07 
 
 		 156 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  77.4 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  76.03 
 
 		 156 aa  230  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  76.71 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  76.71 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  74.15 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  75.34 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  73.47 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  73.47 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  71.81 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  69.13 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  69.54 
 
 		 158 aa  224  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  73.97 
 
 		 156 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  71.14 
 
 		 150 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  68.92 
 
 		 155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  67.55 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  67.12 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  67.12 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  50.35 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  47.92 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  47.92 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  37.9 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  37.9 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  37.9 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  37.9 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  37.9 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  39.55 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  40 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  40 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  38.17 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  31.91 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  34.25 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  34.13 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  34.53 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  35.34 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  38.28 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  34.56 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  35.56 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  38.98 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  30.41 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  35.56 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  34.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  34.59 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  33.08 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  37.01 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  30.77 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  36.05 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  30.28 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  32.17 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  32.17 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  31.91 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  35.37 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  35.37 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  34.09 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  33.08 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  36.72 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  29.17 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  33.08 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  33.79 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  34.33 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  35.16 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  36.22 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  35.66 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  30 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  36.09 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>