177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2053 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  100 
 
 		 177 aa  347  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  78.53 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  69.23 
 
 		 185 aa  220  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  67.07 
 
 		 187 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  67.26 
 
 		 167 aa  213  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  64.85 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  62.07 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  64.63 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  62.05 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  63.41 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  61.68 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  62.58 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  56.97 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  60.61 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  57.89 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  55.15 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  57.23 
 
 		 159 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  57.23 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  57.23 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  54.17 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  54.17 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  55.09 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  53.99 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  55.42 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  55.76 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  51.93 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  50.91 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  51.53 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  51.48 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 234 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  51.98 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  57.05 
 
 		 172 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  52.98 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  54.6 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  47.9 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  44.31 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  41.52 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  50.3 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  35.8 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  41.06 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  37.24 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  37.28 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  43.83 
 
 		 150 aa  104  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  43.62 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  39.73 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  35.4 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  36.36 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  32.1 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  32.1 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  37.09 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  37.33 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  37.33 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  32.52 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  39.22 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  35.76 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  95.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 148 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  38.89 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  38.19 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  34.73 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  37.25 
 
 		 150 aa  90.9  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  39.58 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  33.12 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  33.12 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  36.48 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  36.11 
 
 		 148 aa  84.3  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  32.93 
 
 		 144 aa  84.3  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  36.08 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  35.67 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  38.46 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  35 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  34.84 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  40.43 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  31.9 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  33.12 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  35.42 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  36.55 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  33.33 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  34.38 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  37.5 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  28.66 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  33.77 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  35.06 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  29.17 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  34.46 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  28.03 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  28.03 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  35.46 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  35.46 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>