178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2473 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  66.25 
 
 		 175 aa  201  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  63.91 
 
 		 168 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  64.67 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  65.03 
 
 		 172 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  65.81 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  62.35 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  61.11 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  62.42 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  60 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  60.37 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  62.66 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  62.2 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  56.97 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  52.72 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  59.39 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  57.14 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  56.55 
 
 		 178 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  57.5 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  55.35 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  56.21 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  54.09 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  50 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  53.12 
 
 		 171 aa  150  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  57.32 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  52.9 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  54.61 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  53.95 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  53.95 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  52.94 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  55.9 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  56.6 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  53.16 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  39.74 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  39.74 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  39.74 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  45.45 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  40.76 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  41.4 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  48.15 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  36.6 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  40.96 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  41.55 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  33.76 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  37.89 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  42.86 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  35.67 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  35.67 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 151 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  36.94 
 
 		 149 aa  104  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  35.67 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  33.76 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  36.17 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  36.6 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  37.82 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  37.74 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  43.17 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  32.68 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  32.47 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  32.68 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  43.14 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  32.68 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  32.68 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  40.76 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  40.76 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  35.71 
 
 		 150 aa  89  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  40 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  32.3 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  32.47 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  38.57 
 
 		 148 aa  85.5  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  35.71 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  36.55 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  40.43 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  31.65 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  35.97 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  29.22 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  29.22 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  31.65 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  37.14 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  32.48 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  32.91 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  36.43 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  35.1 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  33.33 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  31.16 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>