178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4126 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  100 
 
 		 162 aa  312  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  66.23 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  63.29 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  63.29 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  62.26 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  62.34 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  59.49 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  62.66 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  64.29 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  61.01 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  64.94 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  58.44 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  56.6 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  61.54 
 
 		 171 aa  150  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  54.6 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  60.26 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  57.24 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  61.59 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  56.76 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  54.04 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  54.43 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  51.85 
 
 		 188 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  53.79 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  53.95 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  54.36 
 
 		 176 aa  140  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  53.42 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  51.57 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  51.85 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  50.93 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  53.47 
 
 		 168 aa  133  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  52.87 
 
 		 184 aa  133  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  48.47 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  52.6 
 
 		 189 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 234 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  49.37 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  43.38 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  36.91 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  34.42 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  34.42 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  41.03 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  42.21 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  34.42 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  39.42 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  42.55 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  39.61 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  43.23 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  41.3 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  36.76 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  40.12 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  43.97 
 
 		 200 aa  98.6  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  40.15 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  38.69 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  38.97 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  37.96 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  32.89 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  32.89 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  38.69 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  35.71 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  34.39 
 
 		 146 aa  85.5  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  33.11 
 
 		 142 aa  85.1  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  45.45 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  39.57 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  35.06 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  33.55 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  45.38 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  45.38 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  37.5 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  35 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  32.35 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  36.67 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  36.67 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  37.5 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  39.42 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1600  ArgR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  37.31 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  37.41 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  31.39 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  31.39 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  31.39 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  39.86 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  30.66 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  30.66 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  35.97 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>