176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1646 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
168 aa  324  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  74.85 
 
 
175 aa  228  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  72.12 
 
 
172 aa  223  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  72.05 
 
 
176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  70.83 
 
 
184 aa  209  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  69.81 
 
 
184 aa  204  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  69.18 
 
 
186 aa  204  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  65.45 
 
 
187 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  63.91 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  64.63 
 
 
177 aa  195  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  63.1 
 
 
185 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  63.87 
 
 
168 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  62.8 
 
 
185 aa  184  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  62.5 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  62.26 
 
 
177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  59.38 
 
 
195 aa  177  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  61.73 
 
 
188 aa  173  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  57.59 
 
 
171 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  56.88 
 
 
161 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  58.86 
 
 
178 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  53.7 
 
 
176 aa  153  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  55 
 
 
161 aa  151  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  55.97 
 
 
159 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  55.97 
 
 
159 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  55.97 
 
 
159 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  59.87 
 
 
184 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  54.72 
 
 
161 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  57.5 
 
 
189 aa  147  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  53.8 
 
 
164 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
234 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  53.94 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  54.55 
 
 
171 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  55 
 
 
172 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  51.57 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  53.47 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  44.79 
 
 
170 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  52.78 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  45 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  44.59 
 
 
152 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  39.13 
 
 
152 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  40.51 
 
 
200 aa  104  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  35.48 
 
 
150 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  34.84 
 
 
150 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  34.84 
 
 
150 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  34.62 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  34.62 
 
 
149 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  34.21 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
153 aa  98.6  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  33.97 
 
 
149 aa  98.2  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  35.48 
 
 
150 aa  97.1  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  33.33 
 
 
149 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  32.14 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  35 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  32.05 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  40.58 
 
 
150 aa  90.5  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  42.42 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  32.26 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  30.13 
 
 
149 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
161 aa  87.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  38.19 
 
 
145 aa  87  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
151 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  34.87 
 
 
141 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  31.17 
 
 
149 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  30.13 
 
 
152 aa  84  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  30.13 
 
 
152 aa  84  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  39.57 
 
 
148 aa  84  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  30.52 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  30.52 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  30.52 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  30.52 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  41.79 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  34.62 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  38.13 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  32.88 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  31.61 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  31.41 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  31.33 
 
 
144 aa  77  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  30.97 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  35.21 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  32.39 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  31.94 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  28.57 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  35.97 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2324  ArgR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  30.66 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  34.78 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  31.21 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  40.3 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  40.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  35.88 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  35.88 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.191978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>