151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0448 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  323  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  84.91 
 
 
162 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  84.91 
 
 
162 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  84.91 
 
 
162 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  84.91 
 
 
162 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  84.91 
 
 
162 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  36 
 
 
158 aa  100  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  36 
 
 
156 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  36.96 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  31.58 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  35.38 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  35.38 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  35.38 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  35.38 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  35.38 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  35.38 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  35.38 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  35.88 
 
 
156 aa  90.5  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  34.59 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  36.64 
 
 
177 aa  90.5  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  34.62 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  34.62 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  34.62 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  34.62 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  33.79 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  35.71 
 
 
156 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  36.64 
 
 
156 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  29.73 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  31.69 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  34.13 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  34.13 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  33.59 
 
 
156 aa  84  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  33.59 
 
 
156 aa  84  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  33.59 
 
 
156 aa  84  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  35.25 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  32.41 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  32.41 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  33.78 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  34.4 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  33.06 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  32.28 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  27.81 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  29.6 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  29.6 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  26.24 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  28.57 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  32.79 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  29.27 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  31.08 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  32.26 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  30.3 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  34.23 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  30.3 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  31.09 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  31.09 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  30.65 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  29.55 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  23.78 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  29.58 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  26.06 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  30.95 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  26.15 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  26.12 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  28.29 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  26.42 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  25.71 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  26.92 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  27.56 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  23.85 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  28.12 
 
 
178 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  28.48 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  27.87 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  28.77 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  23.33 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  26.49 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  23.33 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  27.14 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>