166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1056 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  72.19 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  72.19 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  72.19 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  71.03 
 
 		 156 aa  220  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  71.52 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  69.54 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  70.2 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  69.54 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  69.54 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  69.54 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  69.54 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  70.86 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  68.92 
 
 		 154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  68.97 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  70.34 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  67.11 
 
 		 156 aa  217  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  68.67 
 
 		 158 aa  216  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  68.87 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  68.67 
 
 		 156 aa  215  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  67.79 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  68.21 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  68.21 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  68.97 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  67.57 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  67.57 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  65.56 
 
 		 177 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  64.71 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  62.5 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  60.13 
 
 		 154 aa  200  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  63.51 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  57.52 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  48.32 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  47.59 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  47.59 
 
 		 195 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  37.7 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  37.7 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  37.7 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  37.7 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  37.7 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  37.96 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  37.4 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  37.4 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  37.86 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  37.59 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  32.86 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  35.95 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  33.1 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  37.21 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  35.46 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  34.75 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  31.65 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  35.07 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  35 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  37.32 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  37.6 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  37.6 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  32.88 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  35.33 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  33.55 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  35.38 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  31.58 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  33.59 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  31.79 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  33.77 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  29.86 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  35.11 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  33.59 
 
 		 188 aa  67  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  33.88 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  32.65 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  33.58 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  34.51 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  32.45 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  32.45 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  32.52 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  32.52 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  37.01 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  36.89 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>