157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4864 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  84.91 
 
 
159 aa  276  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  35.1 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  97.1  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  36.23 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  36.76 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  35.1 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  37.9 
 
 
154 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  36.09 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  36.09 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  37.12 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  36.23 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  35.34 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  37.7 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  37.1 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  37.7 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  30.46 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  39.17 
 
 
177 aa  91.3  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  33.57 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  34.59 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  32.47 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  33.83 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  37.4 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  34.85 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  34.85 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  34.85 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  33.08 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  33.08 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  35.11 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  27.52 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  33.85 
 
 
195 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  33.85 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  35.25 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  30.99 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  37.5 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  31.62 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  32.52 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  31.62 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  33.06 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  33.33 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  31.69 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  30.23 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  32.23 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  31.06 
 
 
180 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  32.23 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  28.78 
 
 
177 aa  61.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  32.56 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
184 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  33.33 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  33.61 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  31.62 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  31.78 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  31.78 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  31.78 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  31.25 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  32.52 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  31.78 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  31.78 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  31.01 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  29.29 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  28.79 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  26.17 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  28.57 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  33.56 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  31.4 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  25.53 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  23.84 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  28.79 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>