172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1597 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  100 
 
 
159 aa  316  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  49.31 
 
 
156 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  46.31 
 
 
154 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  47.22 
 
 
156 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  49.64 
 
 
154 aa  131  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  47.92 
 
 
156 aa  130  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  48.61 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  47.92 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  47.92 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  47.92 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  47.92 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  47.92 
 
 
156 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  46.53 
 
 
156 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  47.92 
 
 
154 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  47.52 
 
 
156 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  49.26 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  47.22 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  47.48 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  47.59 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  46.67 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  47.22 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  47.22 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  47.22 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  46.62 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  46.62 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  46.62 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  45.95 
 
 
156 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  47.79 
 
 
156 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  47.76 
 
 
158 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  43.33 
 
 
156 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  44.67 
 
 
156 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  43.33 
 
 
156 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  43.33 
 
 
156 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  43.51 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  44.03 
 
 
156 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  45.04 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  39.6 
 
 
160 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  40 
 
 
158 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  38.4 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  38.4 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  33.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  33.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  33.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  33.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  33.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  38.66 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  33.59 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  33.57 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  36.84 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  30 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  32.56 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  30.43 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  33.79 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  33.79 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  32.61 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  28.57 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  33.59 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  31.5 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  31.06 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  31.75 
 
 
150 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  33.04 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  32.37 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  28.99 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  33.08 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  29.71 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  35.29 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  32.86 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  28.57 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  30.56 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  31.5 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  32.33 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  32.33 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  29.51 
 
 
141 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  33.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>