135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0886 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0886  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
260 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  38.15 
 
 
283 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.33 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  32.92 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  31.51 
 
 
260 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  28.93 
 
 
272 aa  105  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  32.35 
 
 
267 aa  102  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  30.12 
 
 
268 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  32.37 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  29.1 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  30.58 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  30.17 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  30.17 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  25.82 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  26.83 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  28.15 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  30.25 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  30.83 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  29.17 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  28.69 
 
 
253 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  28.98 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.52 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.65 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  32.46 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  30.33 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  28.93 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  31.28 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  28.93 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  28.02 
 
 
257 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  31.14 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  29.51 
 
 
271 aa  88.6  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  30.83 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.41 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  32.16 
 
 
271 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  28.1 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.88 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.87 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  29.03 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  30.29 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  30.17 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  28.68 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.99 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.5 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  25.97 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  29.11 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  28.86 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  26.64 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  29.58 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  28.27 
 
 
263 aa  72  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  34.46 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  29.39 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  35.37 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  27.71 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  29.75 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1345  fructose-bisphosphate aldolase  28.34 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10149  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.97 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.97 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  27.98 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  29.67 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  27.08 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  22.98 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  26.25 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  26.03 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  28.03 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  28.03 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  25.19 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  27.2 
 
 
293 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0265  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.89 
 
 
274 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0294  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.89 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383352  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  27.65 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  26.07 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1193  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.13 
 
 
278 aa  55.8  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233071  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  26.23 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  26.45 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  25.59 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  25.59 
 
 
309 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  26.78 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  26.45 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  26.23 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.88 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  27.5 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  23.55 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  23.34 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  31.17 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  26.03 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  26.03 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  26.34 
 
 
293 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  23.69 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  22.92 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  25.21 
 
 
293 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  26.56 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.12 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>