More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1366 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1366  hemolysin-like protein  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000187888  hitchhiker  0.0000000807238 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  51.28 
 
 
445 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  54.5 
 
 
443 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  51.69 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  38.03 
 
 
440 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  39.19 
 
 
429 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  35.91 
 
 
448 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.4 
 
 
434 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  36.61 
 
 
285 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  37.55 
 
 
311 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  36.33 
 
 
311 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  33.73 
 
 
443 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
291 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 
417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  36.4 
 
 
445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  37.05 
 
 
284 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  36.36 
 
 
425 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  36.8 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  35.47 
 
 
426 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  34.57 
 
 
273 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  35.6 
 
 
295 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 
442 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.36 
 
 
295 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  36.8 
 
 
309 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  35.83 
 
 
431 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1682  protein of unknown function DUF21  39.61 
 
 
443 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000471578  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  35.69 
 
 
278 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
291 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  35.78 
 
 
295 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  35.2 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 
291 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  35.65 
 
 
436 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.93 
 
 
403 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  35.65 
 
 
436 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  35.65 
 
 
436 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.57 
 
 
442 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  34.25 
 
 
445 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  34.25 
 
 
295 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  34.25 
 
 
295 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  33.61 
 
 
418 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  35.78 
 
 
293 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  34.25 
 
 
445 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  36.36 
 
 
309 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  35.59 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  34.21 
 
 
430 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  34.58 
 
 
420 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  34.8 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  38.18 
 
 
431 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  34.19 
 
 
442 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  30.85 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.82 
 
 
421 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  32.07 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.22 
 
 
442 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  34.73 
 
 
285 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
430 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  34.23 
 
 
442 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  38.61 
 
 
250 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  32.22 
 
 
311 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 
433 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  35.34 
 
 
371 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.19 
 
 
299 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  31.72 
 
 
429 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  31.84 
 
 
292 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  32.62 
 
 
461 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  35.48 
 
 
430 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  33.76 
 
 
442 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  33.19 
 
 
279 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  34.02 
 
 
283 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.84 
 
 
445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  31.84 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
293 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  32.06 
 
 
284 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.32 
 
 
292 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  32.07 
 
 
435 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  32.5 
 
 
424 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  31.43 
 
 
425 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  29.06 
 
 
447 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.98 
 
 
291 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.8 
 
 
443 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  34.22 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.49 
 
 
435 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  29.78 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
432 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  32.64 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.79 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  33.64 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  33.64 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>