275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0369 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0369  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  217  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  67.37 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  51.55 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  41.9 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  41.9 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  39.8 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  44.9 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1747  hypothetical protein  43.37 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1560  hypothetical protein  43.37 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.11 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  40.62 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  41.24 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  34.31 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  42.27 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  39.18 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  45.45 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  40.62 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  39 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  39.8 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  38.14 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  41.12 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  40.26 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  39.58 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  36.89 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  43.75 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  40.43 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  37 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  34.74 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  37.23 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  40.79 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  36.17 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  41.11 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  38.78 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  37.62 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  38.54 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  37.76 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  41.49 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf159  hypothetical protein  36.96 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  34.69 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  38.16 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  38.16 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  40.66 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  34.69 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  38.16 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  39.76 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  37.76 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  34.31 
 
 
120 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  37.76 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  36.73 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  37.11 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  35.29 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  37.23 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  35.29 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  39.56 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  32.99 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  36.08 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  40.86 
 
 
104 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  34.31 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  34.31 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  34.31 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  34.31 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  35.29 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  32.29 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  32.29 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  32.29 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  34.31 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  32.32 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  32.04 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  32.22 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  34.31 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>