79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09740 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09740  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  100 
 
 
400 aa  821    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2108  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  54.39 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0984  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  50.7 
 
 
361 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.364733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2335  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  50.14 
 
 
368 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2460  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  49.86 
 
 
368 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0083  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  45.38 
 
 
359 aa  330  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0075  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  40.85 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2392  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  37.26 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.057254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0881  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  36.74 
 
 
363 aa  232  8.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457888  hitchhiker  0.00000000318565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0082  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  37.09 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2368  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.98 
 
 
360 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.907021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1882  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  29.26 
 
 
356 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2325  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.98 
 
 
360 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5362  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.18 
 
 
368 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3532  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.91 
 
 
368 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3894  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.65 
 
 
368 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256011  normal  0.325755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4737  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.38 
 
 
368 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0764325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3626  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.38 
 
 
368 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194438  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0736  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.59 
 
 
360 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879185  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6050  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  30.81 
 
 
362 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2489  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  27.56 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2679  putative opine dehydrogenase  30.05 
 
 
364 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411102  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0671  hypothetical protein  29.31 
 
 
392 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0569  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.39 
 
 
360 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5067  opine dehydrogenase  28.65 
 
 
368 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976673  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0336  hypothetical protein  27.06 
 
 
368 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1794  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.37 
 
 
358 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1521  opine dehydrogenase  28.33 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2393  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  30.03 
 
 
359 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.827107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1563  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.91 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000158964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1485  Opine dehydrogenase  28.12 
 
 
357 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0420  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  25 
 
 
359 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3845  opine dehydrogenase  25.41 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.853646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1678  Opine dehydrogenase  29.04 
 
 
370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.906291 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8271  D-vitopine dehydrogenase  26.85 
 
 
360 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4452  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  24.38 
 
 
359 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1320  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  35.19 
 
 
335 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.385304 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1748  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  22.22 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8195  D-nopaline dehydrogenase  22.79 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0371  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.34 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0622  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0564  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.525167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1477  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.43 
 
 
353 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1270  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
368 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  25.96 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1628  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.41 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000905349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0634  putative lysopine/nopaline/octopine/opine/vitopine/tauropine dehydrogenases family protein  25.29 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0226  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.97 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.631957  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 
319 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2126  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1785  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0136  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 
319 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4181  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.11 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406749  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2057  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.67 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2110  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.67 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.422397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1069  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.03 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3830  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.9 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1214  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.52 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0333  6-phosphogluconate dehydrogenase  29.9 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09720  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.17 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29030  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.01 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2490  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.61 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0008  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.25 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10760  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0423054  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2129  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  29.81 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1096  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0007  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.792922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1286  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1221  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.13 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.344134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10550  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.41 
 
 
341 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0176  6-phosphogluconate dehydrogenase  25.22 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3281  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.59 
 
 
333 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08081  6-phosphogluconate dehydrogenase  25.22 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.055402  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3529  kynurenine 3-monooxygenase  36.62 
 
 
445 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.978115  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1339  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.59 
 
 
333 aa  43.1  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191532  normal  0.587793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(P)+]  31.25 
 
 
345 aa  43.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>