65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0083 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0083  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  100 
 
 		 359 aa  727    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0984  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  59.5 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.364733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2108  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  47.32 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2460  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  48.04 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2335  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  47.77 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09740  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  45.38 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0075  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  34.93 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2392  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  32.33 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.057254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0881  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.34 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457888  hitchhiker  0.00000000318565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0082  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  30.36 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0736  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.37 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879185  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0569  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  30.41 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2679  putative opine dehydrogenase  29 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411102  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2368  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.78 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.907021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2325  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.78 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6050  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.09 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3532  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.54 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3894  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.18 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256011  normal  0.325755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1521  opine dehydrogenase  27.17 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4737  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.18 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0764325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3626  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.18 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2489  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  27.69 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0336  hypothetical protein  26.46 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5362  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.2 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1794  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  25.9 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5067  opine dehydrogenase  27.73 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976673  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2393  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.91 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.827107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1563  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.9 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000158964 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1882  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  26.37 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0671  hypothetical protein  27.91 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1678  Opine dehydrogenase  27.87 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.906291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3845  opine dehydrogenase  27.53 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.853646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1485  Opine dehydrogenase  25.72 
 
 		 357 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4452  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  25.95 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0420  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  21.71 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8271  D-vitopine dehydrogenase  23.21 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655661  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1748  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  23.43 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0080  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.49 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2110  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  22.99 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.422397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1981  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.58 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1022  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.93 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0256064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1628  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.41 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000905349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3683  ketopantoate reductase ApbA/PanE:NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, N-terminal  22.69 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1320  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  25.24 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.385304 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8195  D-nopaline dehydrogenase  20.91 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1270  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.1 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589951  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0564  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.525167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1339  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.67 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191532  normal  0.587793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09720  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.47 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1126  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.59 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2137  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.01 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2129  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  25.25 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4181  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3252  6-phosphogluconate dehydrogenase  26.73 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10550  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.42 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1323  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.04 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1386  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.89 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  24.15 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0931  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.3 
 
 		 462 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2691  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.42 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0497  6-phosphogluconate dehydrogenase  25.6 
 
 		 469 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00911592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0482  6-phosphogluconate dehydrogenase  25.6 
 
 		 469 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3902  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  21.89 
 
 		 385 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0371  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.87 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>