44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0336 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0336  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4737  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  82.88 
 
 
368 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0764325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3626  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  82.88 
 
 
368 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194438  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3894  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  83.15 
 
 
368 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256011  normal  0.325755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2489  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  82.74 
 
 
421 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5362  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  80.71 
 
 
368 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3532  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  79.89 
 
 
368 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5067  opine dehydrogenase  80.82 
 
 
368 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976673  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0736  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  62.47 
 
 
360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879185  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2679  putative opine dehydrogenase  54.86 
 
 
364 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411102  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1485  Opine dehydrogenase  55.34 
 
 
357 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09740  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.06 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2392  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.96 
 
 
365 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.057254  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0083  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.01 
 
 
359 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2335  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  28.12 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0984  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  25.88 
 
 
361 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.364733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2460  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.85 
 
 
368 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0110066  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6050  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  31.48 
 
 
362 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2108  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.31 
 
 
366 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0075  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.64 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2368  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.38 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.907021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2325  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.38 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0082  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.87 
 
 
361 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1882  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  24.17 
 
 
356 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1563  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.98 
 
 
360 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000158964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1521  opine dehydrogenase  25.67 
 
 
358 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0881  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  21.47 
 
 
363 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457888  hitchhiker  0.00000000318565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2393  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.3 
 
 
359 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.827107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1678  Opine dehydrogenase  28.84 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.906291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0420  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.76 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0671  hypothetical protein  25.44 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1794  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.87 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8271  D-vitopine dehydrogenase  25.73 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655661  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3845  opine dehydrogenase  26.7 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.853646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0569  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.36 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4452  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  23.49 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1477  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.38 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2121  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.62 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2467  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.35 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.226319  normal  0.866598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4208  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.35 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29030  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2213  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)+)  35.05 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2490  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.25 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2022  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>