83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0984 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0984  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  732    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.364733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0083  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  59.5 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2108  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  54.52 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09740  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  50.7 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2335  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  48.48 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2460  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  48.48 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0075  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  37.18 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2392  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  33.15 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.057254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0881  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  32.2 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457888  hitchhiker  0.00000000318565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0082  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  31.68 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6050  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  29.31 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0736  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.6 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879185  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2679  putative opine dehydrogenase  28.73 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411102  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5362  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.88 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5067  opine dehydrogenase  27.13 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976673  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3894  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.13 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256011  normal  0.325755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3626  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.13 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4737  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.13 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0764325  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3532  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  26.61 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0671  hypothetical protein  26.74 
 
 		 392 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2393  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  30.41 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.827107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0569  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.86 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2489  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  26.53 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1794  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  23.48 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0336  hypothetical protein  26.13 
 
 		 368 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2325  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.4 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2368  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  27.4 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.907021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1521  opine dehydrogenase  23.84 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1485  Opine dehydrogenase  27.35 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1882  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  27.55 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1678  Opine dehydrogenase  27.79 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.906291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3845  opine dehydrogenase  25.55 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.853646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1563  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  24.5 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000158964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4452  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase family protein  24.71 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0420  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  21.69 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8271  D-vitopine dehydrogenase  20.89 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655661  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1748  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  22.4 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0371  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.94 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1320  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like  25.82 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.385304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1981  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.14 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1339  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191532  normal  0.587793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1221  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.05 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.344134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1022  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.5 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0256064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1129  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.02 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000800663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0598  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.78 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0564  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.25 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.525167  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3830  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.8 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4181  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  23.08 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0006  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.62 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1214  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.31 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2691  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.75 
 
 		 340 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0622  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0008  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.07 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1286  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0226  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.69 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.631957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0136  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.21 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2110  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.43 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.422397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1096  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.19 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1323  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.52 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09720  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.1 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0008  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.62 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03969  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.07 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1628  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.17 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000905349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0931  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.23 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3281  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.85 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3784  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.67 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0586737  normal  0.101354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  24.75 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3697  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.36 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3379  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.76 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1228  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.56 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0007  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.792922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0197  6-phosphogluconate dehydrogenase  31.31 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1560  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.67 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129302  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0407  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.86 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1081  6-phosphogluconate dehydrogenase  28.43 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1429  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.78 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0580166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2121  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0007  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.71 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10760  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.84 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0423054  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  29 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>