More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6885 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6885  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0582  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.29 
 
 
272 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1621  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.76 
 
 
275 aa  205  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39022  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0008  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.56 
 
 
283 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4839  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.32 
 
 
269 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000052182  hitchhiker  0.0000379227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1339  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.56 
 
 
283 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2592  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.6 
 
 
283 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0171535  decreased coverage  0.0000000235348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0389  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.52 
 
 
297 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3072  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.39 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0383  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.48 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5075  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.3 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2649  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.88 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3681  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.71 
 
 
271 aa  195  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000425443  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3076  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.52 
 
 
287 aa  195  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.74 
 
 
302 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4368  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4639  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40 
 
 
296 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3749  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.55 
 
 
270 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03200  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.26 
 
 
271 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3307  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.33 
 
 
293 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0080  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.33 
 
 
293 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0450  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.74 
 
 
270 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0048  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.67 
 
 
293 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.683783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04670  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.74 
 
 
270 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2809  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.71 
 
 
327 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0087  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.67 
 
 
291 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.06 
 
 
275 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  0.175182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1864  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.82 
 
 
271 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00234848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4210  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.11 
 
 
283 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2184  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.71 
 
 
275 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2798  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.71 
 
 
275 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0319  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.86 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3659  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.27 
 
 
293 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.713719999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2969  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.58 
 
 
281 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.158324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2858  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.06 
 
 
284 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6128  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.71 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559175  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3029  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.45 
 
 
283 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4100  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.58 
 
 
297 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0788  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.42 
 
 
274 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4197  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.68 
 
 
270 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0293  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.52 
 
 
297 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0517  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.36 
 
 
275 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.501091  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4416  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  37.1 
 
 
276 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.192339  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0452  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.57 
 
 
288 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.112388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0126  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.21 
 
 
271 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.270322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.21 
 
 
271 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0040  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.47 
 
 
293 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.733521  normal  0.608589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0479  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.55 
 
 
276 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.97 
 
 
270 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.890377  normal  0.0669728 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0143  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.21 
 
 
271 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.497786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0055  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.21 
 
 
271 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0268618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4481  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4316  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.703186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4327  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.86 
 
 
296 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246645  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4830  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3369  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.27 
 
 
284 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00058  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.43 
 
 
269 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4104  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.64 
 
 
271 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3690  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.34 
 
 
271 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4701  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.00822e-32 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0188  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.15 
 
 
272 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0158  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.15 
 
 
272 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4129  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.16 
 
 
276 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0346  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.71 
 
 
284 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1840  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.79 
 
 
274 aa  185  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.649087  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2096  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.86 
 
 
293 aa  185  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.026962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2183  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.86 
 
 
293 aa  185  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0414  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.91 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4717  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.04 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.816439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4761  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.55 
 
 
270 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0758  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.45 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0574  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.45 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0589  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.46 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362043  decreased coverage  0.000844173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3886  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.7 
 
 
271 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.64 
 
 
271 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0590  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.45 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4726  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.05 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3623  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.62 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0078  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.93 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3799  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.06 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0542  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.04 
 
 
276 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149234  hitchhiker  0.000000000000030206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4711  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  36.04 
 
 
276 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0250584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3957  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.05 
 
 
269 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2672  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  38.03 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000821198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4696  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  35.69 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1921  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.93 
 
 
280 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0619  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  38.8 
 
 
293 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0236093  normal  0.724235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0377  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  38.67 
 
 
293 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0162  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.26 
 
 
269 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0616  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  37.37 
 
 
274 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2000  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.62 
 
 
271 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1478  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.25 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00203785  unclonable  0.00000282261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3271  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  35.82 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00866988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0599  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  37.37 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1723  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.01 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5351  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.7 
 
 
270 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2648  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  38.79 
 
 
271 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00588455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  38.52 
 
 
273 aa  178  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00226258  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0212  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  38.65 
 
 
271 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0404302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>