87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5323 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 158 aa  317  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  73.33 
 
 		 154 aa  233  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  70.59 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  68.63 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  67.97 
 
 		 169 aa  228  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  67.11 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  64.33 
 
 		 163 aa  223  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68 
 
 		 153 aa  220  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  65.33 
 
 		 153 aa  220  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  65.33 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  66.89 
 
 		 158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  66.67 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  64.24 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  64.67 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  65.1 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.43 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  63.58 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  28.19 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  29.58 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.08 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.87 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.99 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  33.57 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  26.09 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  31.87 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  44.62 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  41.54 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  28.69 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  32.86 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  32.86 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  31.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  29.58 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  25.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 		 129 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  26.57 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.63 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  27.05 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  26.36 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1989  methylmalonyl-CoA epimerase  27.34 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  30.93 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  27.86 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  30.16 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  30.16 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  29.37 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  23.08 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0555  methylmalonyl-CoA epimerase  26.62 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.23 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  25.35 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  24.48 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  24.66 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1013  methylmalonyl-CoA epimerase  38.46 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.752457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.37 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.08 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  26.56 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  31.5 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  29.79 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.83 
 
 		 158 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  27.34 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 		 139 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  31.01 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  27.91 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  23.78 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  23.78 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  23.78 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  31.75 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  23.78 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  23.78 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  29.7 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  25.71 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>