45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0915 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2812  hypothetical protein  97.6 
 
 
750 aa  1422    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0915  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
821 aa  1619    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2936  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
759 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.822223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  26.96 
 
 
286 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
289 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
301 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
275 aa  54.7  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
525 aa  54.3  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4950  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
319 aa  54.3  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal  0.142154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
300 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 
337 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
1250 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
544 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
276 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
302 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1482  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
301 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
302 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.6 
 
 
312 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
318 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  23.17 
 
 
292 aa  48.9  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
308 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 
957 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
310 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.51 
 
 
317 aa  48.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
1038 aa  48.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7660  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.17 
 
 
303 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  27.82 
 
 
386 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  28.03 
 
 
292 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
470 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.11 
 
 
310 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  28.95 
 
 
311 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.9 
 
 
307 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  29.41 
 
 
319 aa  45.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
313 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
302 aa  45.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 
297 aa  45.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
224 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
689 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
268 aa  44.3  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  24.81 
 
 
708 aa  44.3  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
305 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
306 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3009  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 
296 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0884147  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
318 aa  44.3  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  30.4 
 
 
320 aa  44.3  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>