More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0330 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0330  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
306 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0368  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.83 
 
 
305 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.77 
 
 
314 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.42 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.92 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.58 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.67 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.46 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.58 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.59 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  30.59 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  30.59 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
331 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.55 
 
 
330 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  35.23 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.05 
 
 
326 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.58 
 
 
323 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.93 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  31.39 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.56 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.56 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.1 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.59 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.62 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  30.03 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.85 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.26 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.85 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.77 
 
 
317 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.61 
 
 
315 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.8 
 
 
316 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.07 
 
 
326 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.23 
 
 
331 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.52 
 
 
325 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
317 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.82 
 
 
283 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.46 
 
 
325 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.39 
 
 
326 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.19 
 
 
313 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.19 
 
 
313 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.9 
 
 
316 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.63 
 
 
322 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.54 
 
 
337 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  32.39 
 
 
313 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.71 
 
 
282 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.55 
 
 
318 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.55 
 
 
318 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.88 
 
 
318 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
338 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.9 
 
 
315 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.16 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.78 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.56 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.19 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0816  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.97 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.19 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.93 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.9 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.33 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  31.8 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.9 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.48 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.83 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.02 
 
 
322 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.93 
 
 
311 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.71 
 
 
282 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.18 
 
 
319 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.6 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.67 
 
 
330 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.57 
 
 
313 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.54 
 
 
326 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.54 
 
 
309 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.07 
 
 
325 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.74 
 
 
326 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.95 
 
 
319 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.04 
 
 
322 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.18 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.85 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.93 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.28 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.57 
 
 
313 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.82 
 
 
331 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.62 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.04 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.25 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.25 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.42 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.86 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.82 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>