35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1672 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1672  universal stress protein  100 
 
 
101 aa  205  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2851  hypothetical protein  36.78 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.130052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  35.06 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.83 
 
 
415 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.29 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3732  UspA domain protein  35.23 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.212348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.56 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  33.77 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.07 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  28.24 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31.76 
 
 
301 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30.43 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  37.36 
 
 
140 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.96 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  35.06 
 
 
154 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
145 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.91 
 
 
309 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.17 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  33.77 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.82 
 
 
290 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.07 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.59 
 
 
142 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.56 
 
 
296 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.33 
 
 
281 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>