34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1089 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1089  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
316 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.149078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 
365 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
705 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  22.87 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 
699 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  22.87 
 
 
254 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 
254 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  22.87 
 
 
254 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  22.42 
 
 
254 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 
249 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  21.97 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.42 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  21.58 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.77 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  21.11 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.65 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  23.79 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  21.95 
 
 
228 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  22.16 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  20.1 
 
 
263 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  26.51 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 
520 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2434  polysaccharide deacetylase family protein  25.98 
 
 
785 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00787871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  20.93 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  20.67 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 
440 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  21 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  22.17 
 
 
264 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
242 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>