More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0215 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0215  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  41.91 
 
 
162 aa  116  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.91 
 
 
162 aa  116  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.6 
 
 
149 aa  116  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.42 
 
 
162 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0145  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  37.5 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.702609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.5 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  34.64 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.89 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.3 
 
 
159 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  37.5 
 
 
155 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0176  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.64 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1516  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.06 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3801  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  41.91 
 
 
164 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0985632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.53 
 
 
160 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1317  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.93 
 
 
161 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1369  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.93 
 
 
161 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
163 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.03 
 
 
168 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3518  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.59 
 
 
172 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38 
 
 
165 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  31.58 
 
 
187 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  33.55 
 
 
165 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  35.77 
 
 
166 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  32.24 
 
 
157 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  33.33 
 
 
165 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  34.21 
 
 
165 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.35 
 
 
151 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0995  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.76 
 
 
164 aa  101  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.41379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.25 
 
 
163 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  33.55 
 
 
165 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.93 
 
 
161 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.25 
 
 
163 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  32.89 
 
 
165 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.31 
 
 
162 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  32.03 
 
 
166 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  34.06 
 
 
180 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.03 
 
 
176 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  32.89 
 
 
165 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  32.03 
 
 
166 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  32.89 
 
 
165 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0531  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.31 
 
 
163 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00863384  normal  0.0986491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3599  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.03 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  31.58 
 
 
183 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  36.09 
 
 
163 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  31.97 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.37 
 
 
176 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.72 
 
 
171 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  29.25 
 
 
165 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  31.29 
 
 
166 aa  98.6  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.55 
 
 
177 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  31.37 
 
 
172 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  31.58 
 
 
173 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  32.68 
 
 
170 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  30.72 
 
 
181 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.97 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.97 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  34.07 
 
 
173 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.97 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1924  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30 
 
 
184 aa  97.1  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.2 
 
 
157 aa  97.1  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1169  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.06 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.516989  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  36.36 
 
 
180 aa  96.3  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.53 
 
 
208 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  32.24 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1653  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.12 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.27 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1393  formate dehydrogenase subunit gamma  33.11 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0726  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.51 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  37.14 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  31.79 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.37 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  35.14 
 
 
181 aa  94.7  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1151  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.69 
 
 
154 aa  94  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.995235  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24660  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  31.58 
 
 
162 aa  93.6  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.82 
 
 
160 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.6 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  39.84 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  31.17 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.29 
 
 
222 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0846  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.21 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  35.07 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  35.07 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0165  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.33 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1109  bidirectional hydrogenase complex protein HoxE  30.77 
 
 
205 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.130681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1546  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.85 
 
 
228 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334558  normal  0.48465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>