204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0173 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0173  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
321 aa  637    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1659  flagellar motor switch protein FliM  32.27 
 
 
322 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  27.67 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
339 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  28.89 
 
 
334 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  26.42 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  27.63 
 
 
335 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  29.02 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  30.37 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  28.08 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  26.42 
 
 
322 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
322 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.85 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.85 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.85 
 
 
322 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  25.9 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  26.42 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  26.15 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  26.13 
 
 
334 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  28.61 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  26.32 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  25.91 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  25.16 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  26.6 
 
 
323 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 
325 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  27.66 
 
 
336 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 
334 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 
343 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 
325 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 
343 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 
343 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.91 
 
 
326 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  26.09 
 
 
341 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  25.69 
 
 
336 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
326 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 
349 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  25.68 
 
 
322 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  26.81 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 
348 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  25.39 
 
 
334 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  24.39 
 
 
338 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  29.63 
 
 
352 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  26.9 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  26.9 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  25.39 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 
326 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  24.62 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  24.62 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
342 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 
333 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  24.69 
 
 
343 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  23.93 
 
 
332 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  23.72 
 
 
337 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  27.88 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  23.01 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  25.45 
 
 
328 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  23.93 
 
 
350 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  23.01 
 
 
332 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  23.71 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.37 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  23.96 
 
 
337 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 
337 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  25.76 
 
 
328 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  25.64 
 
 
343 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
327 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  25.63 
 
 
347 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>