36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1405 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00110719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2989  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1211  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1854  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3398  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3982  helix-turn-helix domain-containing protein  44.62 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000105146  normal  0.107406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1971  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320655  normal  0.0438636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01955  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  30.88 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0453  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  30.88 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  33.9 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4938  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 95 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484665  hitchhiker  0.0000000184601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  27.94 
 
 		 66 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0775  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 622 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000679131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  48.65 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  38 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 346 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>