234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0531 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0531  rhodanese-like protein  100 
 
 		 445 aa  900    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0450  rhodanese domain-containing protein  56.75 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000189467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4123  Rhodanese domain protein  56.32 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2940  putative lipoprotein  45.63 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.133271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4032  lipoprotein, putative  41.98 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00291213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1205  rhodanese-like protein  35.27 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00418355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0444  rhodanese domain-containing protein  29.64 
 
 		 641 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  31.37 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 		 291 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  29.04 
 
 		 285 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  29.32 
 
 		 293 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  29.32 
 
 		 293 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 		 277 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  28.09 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  28.09 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  28.09 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  29.06 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  29.48 
 
 		 277 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  27.2 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  25.83 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  28.68 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  27.3 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  24.19 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  25.66 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  26.49 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  24.38 
 
 		 291 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  27.37 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  25.5 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  27.24 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  26.22 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  27.24 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  24.92 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  26.19 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  26.58 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  25.91 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 		 296 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  24.91 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  26.43 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  25.27 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  25.56 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  27.55 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  28.36 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  25.76 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  24.32 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  26.59 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  26.01 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  25.46 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  26.14 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.92 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  26.94 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  26.52 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  26.89 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25 
 
 		 284 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  27.76 
 
 		 289 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.52 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  27.24 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  28.85 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  24.11 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.33 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  23.48 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  26.91 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  28.74 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  27.14 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  26.82 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.47 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  25.36 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  25.9 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  25.76 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  24.91 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  25.43 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  25.09 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  25.38 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  25.93 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  23.97 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  25.55 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  27.36 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.55 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  24.91 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  25.09 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  23.4 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  25.95 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  25.95 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  25.95 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  24.14 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  26.2 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  25.82 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>