152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2940 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2940  putative lipoprotein  100 
 
 
468 aa  942    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.133271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4032  lipoprotein, putative  69.47 
 
 
467 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00291213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0450  rhodanese domain-containing protein  45.44 
 
 
458 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000189467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0531  rhodanese-like protein  45.57 
 
 
445 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4123  Rhodanese domain protein  43.56 
 
 
422 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1205  rhodanese-like protein  35.42 
 
 
450 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00418355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0444  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
641 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  28.67 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.32 
 
 
285 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  28.47 
 
 
280 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  27.57 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.73 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.67 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  25.95 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  25.95 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  28.83 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  26 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0068  rhodanese-related sulfurtransferase  24.46 
 
 
496 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  26.22 
 
 
305 aa  67  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  28.99 
 
 
295 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  25.86 
 
 
282 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  26.02 
 
 
279 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  26 
 
 
289 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  26.53 
 
 
331 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  25.23 
 
 
297 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  25.09 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  27.54 
 
 
288 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  24.07 
 
 
296 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  24.4 
 
 
288 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  23.38 
 
 
297 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  26.28 
 
 
308 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  28.07 
 
 
324 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 
324 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  26.76 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  24.8 
 
 
285 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  25.61 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  27.97 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  24.73 
 
 
279 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  25.18 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 
291 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  23.28 
 
 
290 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  25.09 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  25.26 
 
 
281 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  26.37 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  23.33 
 
 
273 aa  57.4  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  25.45 
 
 
297 aa  57  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  21.69 
 
 
283 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  27.44 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  32.89 
 
 
284 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  27.37 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  27.94 
 
 
289 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  21.38 
 
 
291 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  24.84 
 
 
282 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  25.64 
 
 
297 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  23.36 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  24.48 
 
 
306 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 
281 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  25.09 
 
 
298 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  25.09 
 
 
298 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  25.09 
 
 
298 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  24.66 
 
 
281 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1647  rhodanese domain-containing protein  22.26 
 
 
343 aa  53.5  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368982  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  25.09 
 
 
291 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  25.78 
 
 
288 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  23.44 
 
 
282 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  24.54 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.54 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  24.47 
 
 
305 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  25.8 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  23.69 
 
 
291 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  24.41 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  24.1 
 
 
290 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  24.53 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  24.61 
 
 
279 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  23.93 
 
 
285 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  25.71 
 
 
281 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  24.41 
 
 
314 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  23.34 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  25.52 
 
 
275 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.18 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  29.26 
 
 
293 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 
282 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  25.25 
 
 
305 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  23.96 
 
 
647 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  24.13 
 
 
307 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  25.07 
 
 
303 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  23.53 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 
275 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  24.32 
 
 
300 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  24.91 
 
 
277 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  24.91 
 
 
277 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  25.42 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  24.91 
 
 
277 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  26.4 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  27.83 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>