207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1205 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1205  rhodanese-like protein  100 
 
 
450 aa  901    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00418355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4032  lipoprotein, putative  39.02 
 
 
467 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00291213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4123  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
422 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2940  putative lipoprotein  36.88 
 
 
468 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.133271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0450  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
458 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000189467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0531  rhodanese-like protein  35.67 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0068  rhodanese-related sulfurtransferase  25.56 
 
 
496 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0444  rhodanese domain-containing protein  28.92 
 
 
641 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  25.48 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  28.78 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  27.48 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  25.9 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  27.14 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  25.53 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  25.23 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  25.23 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  27.56 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  25.23 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  25.76 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  25.23 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  24.92 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  25.23 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  25.23 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  25.15 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  26.1 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  24.67 
 
 
285 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  25.58 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  24.92 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  25.78 
 
 
295 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  24.53 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  24.44 
 
 
286 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  25.17 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  25.17 
 
 
287 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  26.58 
 
 
647 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  25.25 
 
 
295 aa  64.7  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  21.88 
 
 
366 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1690  rhodanese domain-containing protein  24.42 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  26.78 
 
 
300 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  27.72 
 
 
285 aa  63.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  25.24 
 
 
355 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  26.06 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  23.69 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  24.08 
 
 
291 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  26.77 
 
 
319 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  25.62 
 
 
293 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  24.83 
 
 
287 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  22.96 
 
 
296 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  25.18 
 
 
284 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  26.69 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  24.23 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  25.61 
 
 
286 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1376  rhodanese-like protein  27.62 
 
 
282 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  23.26 
 
 
288 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  24.67 
 
 
290 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  25.83 
 
 
291 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  25 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  25.27 
 
 
282 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  24.55 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  25.09 
 
 
277 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  25.09 
 
 
277 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  25.09 
 
 
277 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  25.09 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  23.91 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1647  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 
343 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368982  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  25.27 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  23.69 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  25.09 
 
 
277 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
291 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  23.83 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  24.73 
 
 
277 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  25.09 
 
 
277 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  25.09 
 
 
277 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  25.37 
 
 
283 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  24.3 
 
 
298 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  25.36 
 
 
287 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  25.19 
 
 
281 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  25.44 
 
 
291 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  24.92 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  25.98 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  24.65 
 
 
277 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  24.69 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  24.6 
 
 
331 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  26.22 
 
 
278 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  26.86 
 
 
333 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  25 
 
 
305 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  24.91 
 
 
282 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  24.16 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  25.98 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  25.51 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  22.73 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  27.11 
 
 
303 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1559  rhodanese domain-containing protein  25.61 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  25.19 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  23.08 
 
 
286 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  25 
 
 
279 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  23.19 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  25.55 
 
 
277 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.45 
 
 
284 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  24.64 
 
 
300 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>