297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0049 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0056  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.159336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0029  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.304599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0303  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0027  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0062  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0001  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0001  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4595  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.372122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0001  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0015  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0014  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.434333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0066  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.171209  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0045  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323703  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0044  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709803  normal  0.0256075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0003  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna10  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0011  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t05  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0006  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0013  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.249758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0001  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336526  hitchhiker  0.00896286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0006  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0288  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0058  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0009  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0067  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0010  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0068  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  0.377618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0040  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0004  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000567869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0006  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000140525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0005  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0004  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309086  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309161  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309117  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0043  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000141342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0003  tRNA-Arg  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00889349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0033    85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.465257  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0036  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA24  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0026  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0019  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737932  normal  0.0155784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0029  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0030  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.324137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0007  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA32  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0006  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0012  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.802134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0008  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0060  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.864941  normal  0.898441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0009  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.702831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6004  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0043  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0006  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.981742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0053  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0038  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0050  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.557723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0050  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0094  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000391203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0093  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000449843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0095  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0095  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000787124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0024  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0021  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  0.330692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0091  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00116714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0038  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000238811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0039  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000255751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0041  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0089  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00125706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0040  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000315714  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0041  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000275058  normal  0.527619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>